殼寡糖是自然界中唯一帶正電荷陽離子堿性氨基低聚糖，是動物性纖維素。殼寡糖是由來源于蝦蟹殼的殼聚糖降解成的帶有氨基的小分子寡糖，是聚合度2~20的糖鏈。
殼寡糖是是甲殼素、殼聚糖產品的升級產品，具有殼聚糖不可比擬的優越性。采用先進的生物酶解法制備殼寡糖，它具有：分子量低、水溶性好、功能作用大、易被人體吸收、生物活性高等優勢。同時具有純天然、無輻射、無污染、無添加等特點。
殼寡糖制備方法有很多，本篇主要介紹酸解法和氧化法兩種。
一、酸解法
殼聚糖分子中的游離氨基可以和酸性溶液中的氫離子結合，使殼聚糖長鏈中分子間氫鍵斷裂，形成多個聚合度不等的分子，即為殼寡糖。常用于降解的酸有HCl、H2SO4、HNO3和H3PO4等。殼聚糖發生降解時酸解的時間越長、酸濃度越大、溫度越高時，降解速率越快，產物的聚合度越低，并且在100 oC條件下將5.0 mg/mL 殼聚糖用6.0 mol/L HCl水解3 h后，產生了33.6%的低聚氨基葡萄糖。在60 oC、9.0 mol/L HCl水解殼聚糖50 h的反應條件下，制備得到的殼五糖和殼六糖的含量最高，共占16.2%。酸解法工藝操作簡單，但反應劇烈，極易腐蝕設備并污染環境，后續處理困難，在實際生產中單一運用較少，常與其他方法結合使用。
二、氧化法
氧化法是利用氧化劑在水溶液中形成的游離自由基去斷裂殼聚糖的糖苷鍵，從而形成聚合度不等的殼寡糖的制備方法。工業生產常用氧化劑為H2O2和HClO等，該法反應迅速，產率較高，成本低并對環境污染較少。在實驗中得到了制備聚合度低于6的殼寡糖的最佳工藝條件：4.5%的H2O2溶液、56 oC反應6 h。用H2O2水解蟬殼制備殼寡糖，得出最佳制備條件為：2.0%的H2O2溶液、pH5.0、溫度65 oC反應4 h，產物的平均聚合度下降到4.5。此外，楊蘇亮等提出：當氧化劑的濃度越大、溫度越高，所需降解時間越短，產率越高；但是，在過高的氧化劑濃度和反應溫度下，殼聚糖會發生水解過度，使產物中單糖和二糖占比較大，而寡糖較少，并且產物氨基損失較多，顏色因褐變加深，品質下降，所以應合理選擇最適的制備條件。實際生產中，通常先用氧化劑部分降解殼聚糖后，再用其他方法繼續純化得到殼寡糖。